Inhaltsverzeichnis
Apfelmännchen in Open MPI
Vorbereitungen
- Linux, Open MPI Entwicklerpakete installieren (Ubuntu: openmpi-bin openmpi-doc libopenmpi-dev)
- passwortloser SSH-Zugriff auf beteiligte Maschinen
Quellcode
Das OpenMP-Programm wurde für MPI nach einem Client/Server-Ansatz umgeschrieben. Vom Master-Prozess werden einzelne Zeilen(nummern) an Slave-Prozesse übergeben, die berechnete Zeilen als Felder zurückliefern.
//: mpi_mandelbrot.cpp : Demo Open MP / Open MPI - R.Richter 2011-01-20 /////////////////////////////////////////////////////////////////////// // g++ -fopenmp ... für Open MP // mpic++ ... für Open MPI #define USE_MPI #include <iostream> #include <complex> #include "image.h" #ifdef USE_MPI #include <mpi.h> char processorName[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME] = "myHostName"; #endif #define MASTER 0 #define GOTOWORK 1 #define GOTODIE 2 typedef std::complex<double> complex; int compute(complex c, int maxIterations) { int count = 0; complex z; while (abs(z) <= 2.0 && count < maxIterations) { z = z * z + c; ++ count; } return count; } inline Color color(int height, int max) { // color scheme from: // http://shreyassiravara.wordpress.com/2010/08/14/the-mandelbrot-set/ if (height >= max) return Color::BLACK; double h = 255 * log(double(height)) / log(double(max)); return Color(0.9 * h, 0.8 * h, 0.6 * h); } inline double scale(int pos, int length, double low, double high) { return low + pos * (high-low) / (length-1); } #ifdef USE_MPI void send(int line, int size, int task, int tag) { MPI_Send(&line, size, MPI_INT, task, tag, MPI_COMM_WORLD); if (tag == GOTOWORK) { std::cout << "Line " << line << " sent to process " << task << std::endl; } } int incoming(std::vector<int>& results) { MPI_Status status; MPI_Recv(&results[0], results.size(), MPI_INT, MPI_ANY_SOURCE, MPI_ANY_TAG, MPI_COMM_WORLD, &status); int task = status.MPI_SOURCE; std::cout << "Line " << results[results.size() - 1] << " received from process " << task << " (" << processorName << ")" << std::endl; return task; } void process(Image& image, std::vector<int> const& iterations, int max) { int const width = iterations.size() - 1; int const y = iterations[width]; for (int x = 0; x < width; ++x) { image.pixel(x, y) = color(iterations[x], max); } } #endif // USE_MPI void master(int nProcesses) { std::cout << "starting master of " << nProcesses << " tasks" << std::endl; int width = 500; int height = 500; Image image(width, height); int maxIterations = 10000; complex left_bottom(-2.0, -2.0); complex right_top ( 2.0, 2.0); #ifndef USE_MPI // serial program or shared-memory parallelism with Open MP: #pragma omp parallel for for (int y = 0; y < height; ++y) { for (int x = 0; x < width; ++x) { complex c(scale(x, width, real(left_bottom), real(right_top)), scale(y, height, imag(left_bottom), imag(right_top))); int iterations = compute(c, maxIterations); image.pixel(x, y) = color(iterations, maxIterations); } } #else // USE_MPI // broadcast global data to all other processes int buffer1[3] = { width, height, maxIterations }; double buffer2[4] = { real(left_bottom), imag(left_bottom), real(right_top), imag(right_top) }; MPI_Bcast(buffer1, 3, MPI_INT, MASTER, MPI_COMM_WORLD); MPI_Bcast(buffer2, 4, MPI_DOUBLE, MASTER, MPI_COMM_WORLD); // distribute first lines to all other processes int line = 0; for (int task = 1; task < nProcesses; ++task, ++line) { send(line, 1, task, GOTOWORK); } std::vector<int> results(width + 1); // iterations + lineNr for ( ; line < height; ++line) // until all lines processed { int task = incoming(results); send(line, 1, task, GOTOWORK); process(image, results, maxIterations); } for (int task = 1; task < nProcesses; ++task) // all outstanding tasks { incoming(results); send(0, 0, task, GOTODIE); process(image, results, maxIterations); } #endif // USE_MPI saveBMP("mandel.bmp", image); } void slave(int myId) { std::cout << "starting slave " << myId << std::endl; #ifdef USE_MPI // get global data broadcasted from master int buffer1[3]; double buffer2[4]; MPI_Bcast(buffer1, 3, MPI_INT, MASTER, MPI_COMM_WORLD); MPI_Bcast(buffer2, 4, MPI_DOUBLE, MASTER, MPI_COMM_WORLD); int width = buffer1[0]; int height = buffer1[1]; int maxIterations = buffer1[2]; complex left_bottom ( buffer2[0], buffer2[1]); complex right_top ( buffer2[2], buffer2[3]); while (true) { // get work : line number MPI_Status status; int y; MPI_Recv(&y, 1, MPI_INT, MASTER, MPI_ANY_TAG, MPI_COMM_WORLD, &status); if (status.MPI_TAG == GOTODIE) break; // do work : compute a vector of data std::vector<int> iterations(width + 1); iterations[width] = y; // store line number for return here for (int x = 0; x < width; ++x) { complex c(scale(x, width, real(left_bottom), real(right_top)), scale(y, height, imag(left_bottom), imag(right_top))); iterations[x] = compute(c, maxIterations); } // send results MPI_Send(&iterations[0], width+1, MPI_INT, MASTER, 0, MPI_COMM_WORLD); } #endif // USE_MPI } int main(int argc, char* argv[]) { int nProcesses = 1; int myId = MASTER; #ifdef USE_MPI MPI_Init(&argc, &argv); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &nProcesses); MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myId); int nameLength = MPI_MAX_PROCESSOR_NAME; MPI_Get_processor_name(processorName, &nameLength); #endif std::cout << "Hello from process " << myId << " of " << nProcesses << std::endl; if (myId == MASTER) master(nProcesses); else slave(myId); #ifdef USE_MPI MPI_Finalize(); #endif return 0; }
Übersetzung, Konfiguration, Ausführung
Übersetzen
mpic++ hello.cpp -o hello
Ausführen
Das Programm kann lokal unter Angabe der gewünschten Prozessanzahl (beim Master/slave-Ansatz mindestens 2) gestartet werden.
mpirun -np 8 mpi_mandelbrot
Zum verteilten Ausführen muss das Programm auf allen beteiligten Maschinen vorhanden sein und passwortloser SSH-Zugang (siehe unten) auf die Maschinen möglich sein. Das Machinefile listet die beteiligten Maschinen mit Hostname oder IP-Addresse auf:
# my_hostfile 192.168.0.205 192.168.0.208 slots=4 max_slots=8
Die Angabe der (maximal) zu startenden Prozesse ist optional. Der Programmstart erfolgt mit
mpirun --hostfile my_hostfile mpi_mandelbrot
oder
mpirun --machinefile my_hostfile mpi_mandelbrot
Die Ausgaben aller Programme erscheinen auf der Konsole des MPI-Hauptprozesses.
passwortloser SSH-Zugang
1. auf dem Master-System ein SSH-Schlüsselpaar erzeugen (ablegen unter ~/.ssh)
ssh-keygen -t rsa
2. mit Editor Inhalt von ~/.ssh/rsa.pub auf Zielsystem in ~/.ssh/authorized_keys2 einfügen
Zeitmessung
Die Ausführung erfolgte in Ubuntu innerhalb eines VirtualBox-Systems.
Die MPI-Version benötigte auf der Einzelmaschine mit 8 Prozessen 100 Sekunden. Zum Vergleich dazu die OpenMP-Version 88 Sekunden. Da VirtualBox nur einen CPU-Kern des Hostsystems (AMD Turion 64, 2.1 GHz unter Windows 7 64bit) auslastet, ist dieser Zeitbedarf mit einem Einzelprozess auf dem Hostsystem vergleichbar.
Auf mehrere Maschinen (virtuelle und native Linux-Systeme) verteilt, verkürzt sich die Gesamtrechenzeit. Vor der ersten Rückmeldung der Client-Prozesse vergehen allerdings einige Sekunden für den Aufbau der SSH-Verbindung.